[Solar-general] Mas código para BioPython

[Sebastian Bassi]

Diego Saravia wrote:
> que es la version server?
> que diferencia tiene con la otra?

Conceptualmente la diferencia es que no es para usar en la PC que se 
"instala", sino que se usaria desde otras en red con un browser.
En la practica, es lo mismo que la otra, pero sin X, sin algunos 
programas que eran de usa de consola y con un webserver activo y con 
paginas estaticas y paginas con CGI y bases de datos, todo coordinado. 
Si vos ahora booteas la version server, cuando te logueas te dice:
Point your browser to http://[ALGO]
Ese [ALGO] es el IP de la máquina, que lo obtengo de un script de una 
linea (que ademas podes correr vos poniendo ./myip desde la linea de 
comandos). Entonces, cuando alguien que esta en red con DNALinux Server 
pone esa IP en su navegador, ve un menu que está el programa BLAST. 
BLAST es el mismo programa que se encuentra aca: 
http://www.ncbi.nih.gov/BLAST/
La diferencia es que usando este server, las busquedas (BLAST es un 
programa para hacer busquedas geneticas) las haces en TU maquina o en al 
menos en un server tuyo, esto trae estas ventajas:
1) La busqueda es confidencial, porque en estos casos, el patrón de 
busqueda que uno usa, suelen ser secuencias geneticas que pueden ser 
confidenciales/propietarias. La alternativa de usar el server público 
para esto es peligrosa porque las queries viajan abiertas, sin SSL.
2) Uno no está en cola, en el server publico a uno lo ponen en colas de 
hasta 30 minutos. Aca uno lo comparte solo con su red interna y puede 
que uno este usandolo solo, lo que lo hace mas rápido.
3) Uno puede cargar su propia base de datos que sea buscable. En el 
server publico, uno puede elegir entre pocas opciones. Con esto, uno 
puede hacer la base de tamaño y variedad tan arbitrario como uno quiera 
(con la limitación de que entre en el CD).
El servidor que se usa es Monkeyd, que es un proyecto chileno, tiene la 
ventaja de ser mucho mas chico que lo comun. No será apache pero hace su 
trabajo. El CGI está hecho en bash y llama a un programa en C.
Comercialmente, viene con 2 bases de datos, los genomas de SARS y de la 
viruela. Si vos necesitas que el CD tenga otra (lo mas probable), vas a 
tener 2 opciones:
1) Lo instalas vos, total es GPL y tenes derecho a modificarla. Hacer 
esto requiere tener algún linux funcionando y algunos conocimientos de 
Linux.
2) Nos pagas a nosotros por el trabajo. Nos decis que base/s queres y la 
incorporamos en un nuevo CD "customizado", con un costo por el trabajo 
de personalización.




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Best regards,

//=\ Sebastian Bassi - Diplomado en Ciencia y Tecnologia, UNQ   //=\
\=// IT Manager Advanta Seeds - Balcarce Research Center -      \=//
//=\ Pro secretario ASALUP - www.asalup.org - PGP key available //=\
\=// E-mail: sbassi en genesdigitales.com - ICQ UIN: 3356556 -     \=//

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