Luciano, cuando corriste el comando "make modules_install" para compilar el kernel, te aparecía este mensaje?
ututo-xs linux-3.16.1 # make modules_install
INSTALL arch/x86/crypto/crc32-pclmul.ko
WARNING: can't open config file: /etc/ssl/openssl.cnf
WARNING: can't open config file: /etc/ssl/openssl.cnf
INSTALL arch/x86/crypto/crc32c-intel.ko
WARNING: can't open config file: /etc/ssl/openssl.cnf
WARNING: can't open config file: /etc/ssl/openssl.cnf
Es correcto que no encuentre el ssl ya que en la ISO no está instalado.
Yo por mi parte voy a dejar compilando de ese modo para ver si es una advertencia, tal cual dice en el mensaje, o trae problemas mas adelante.
En cuanto a tu pregunta, no se me ocurre en este momento que puede ser.
Saludos.
Diego Calbo