Hola guillle a mi me pasaba algo similar una vez y era por cuestiones graficas nada mas, prueba copiar por consola
con "cp" o utilizando algun aplicativo como MC.
Y quizas es simplemente algo del xorg, bueno probale con eso, yo una vez tuve ese bardo y solo copiaba con konqueror y no con nautilus. O sino proba los permisos, aveces queda loquito el ubuntu y te copia hasta que salta lo de los permisos.
Te comento que no tanta gente esta usando el 8.10 pq esta bastante inestable en algunas cuestiones.
un abrazo