da igual pero ejejej es mejor que estean separados.
por ejemplo
disco 1 - grub + Musix
disco 2 - uilo$$zzz
atención que es necesario que el grub "engañe" al windows para que este arranque de un disco secundario
ver chainloader
http://softwarelibre.uca.es/node/view/211
por ejemplo
instalar en el mismo disco tiene el inconviniente de que cuando sea necesario formatear y reinstalar el windows (que es siempre necesario hacer con windows) este al ser un bruto con la instalación te desinstalará el grub del MBR