Hola Román, Al borrar esa carpeta, borraste integro al sistema, por lo cual no quedan archivos del sistema ALBA.
También deberías borrar, si tenés algo configurado en el apache, y reiniciar el servicio y también borrar la base de datos.
De todas, formas, al eliminar la carpeta del sistema, como mencionaste, sería suficiente.
A simple vista leyendo el log, parece un bot y en el archivo de log error.log indica que no existe la carpeta, lo cual está bien.